利用基因芯片進行肺癌分型

　　在線版Proceeedings of National Academy of Sciences（PNAS）報道：Dana-Farber癌症研究中心的科學家們采用小型芯片對上千個基因的活動快速掃描，從而根據基因功能來鑒别新型肺癌，而不像以前一樣在顯微鏡下按細胞形态分類。

　　研究者們說，對肺癌進行有效分型是研究的第一步，進一步的研究将試圖開發出更精确的診斷工具，并能對頭号癌症殺手進行更好的治療。

　　由于在技術上将腫瘤分型是依據癌症細胞中上千基因的“開”和“關”，科學家們能捕捉到每個腫瘤類型的基因“信号”。使用這種信号可以将兩種類型很相似但預後明顯不同的腫瘤區别開來，從“信号”上可以區分出一種腫瘤患者要比另一種平均少存活1年半。科學家們也利用基因信号區分原發性肺癌和繼發性肺癌（來自其他部位的轉移腫瘤），這是目前的方法無法區分的。

　　在最常見的肺癌－腺癌中，“我們是首次發現一個新的生物學分型”，Dana－Farber和哈佛醫學院的病理助教Matthew Meyerson博士說，“我們認爲這種分型與臨床相關”能幫助決定治療方案。在2001年11月13日在線版的Proceeedings of National Academy of Sciences（PNAS）上，Matthew博士是論文的第二作者，報告将于11月20日刊登在雜志的印刷版上。

　　第一作者是Arindam Bhattacharjee博士，美國Meyerson實驗室的博士後。其他的作者包括William G. Richards博士；劍橋生物醫藥Whitehead研究中心的兒科腫瘤專家Todd R. Golub博士；以及Dana-Farber和Brigham and Women醫院的David J. Sugarbaker醫生。

　　與其他腫瘤相比，例如血液系統腫瘤，肺癌很難分型，Meyerson說，就連最有經驗的病理學家也會得出不一緻的結果。問題在于，肺癌與白血病或淋巴瘤相比，其獨特的腫瘤标志物太少，或是幾乎沒有容易鑒定的鑒别标志。這也是專家們面對實體瘤的同樣困難。

　　在肺癌的實驗中，研究者們得到203個肺組織樣本，其中的139個是腺癌。研究者從樣本中抽提RNA，放在包含1萬2千6百個基因的基因芯片上，以确定活化和靜默基因。

　　來自腫瘤樣本的RNA與芯片上的一些特定基因序列結合，由此可确定RNA及其互補基因序列。計算機通過測量RNA的熒光亮度，由此判斷表達基因的活化。

　　經過複雜的數學分析後，腫瘤樣本的基因圖譜将通過圖像顯示進行并列比較。具有相同開－關模式基因的腫瘤被歸到同一類别。一般情況下，由基因分析的肺癌主要類别與傳統病理分類相符，Golub說。

　　然而，“我們也發現目前常規方法不能鑒别的腺癌亞型，” 他說。迄今爲止，隻鑒定出C1,C2,C3和C4亞型。每一類型都是有非常活躍或及其不活躍的基因爲标志，而且在生物學上，這四型都有不同的表現。

　　例如，C2型腺癌的患者比其他三類的存活更差：平均生存期爲21個月，而從C1，C3或C4都有40.5個月的時間。此外，還能将與抽煙關聯最弱的腫瘤分類出來。

　　由于分析結果顯示不同類型的基因活性，研究者預想将來的藥物可以對每個腫瘤的一個或多個基因而度身訂做，且不傷害正常細胞。當然，這些想法目前還不是可以輕易就能實現的。

　　“我想強調一點，我們的這些分型還沒有一個用于臨床，在目前的病人身上也沒有開始試驗，”Golub說。“我們非常小心，不希望在我們還沒有完全清楚前就改變目前的治療标準。”