按肛管與括約肌的關系将肛瘘分爲4類

　　1.括約肌間肛瘘　多爲低位肛瘘，最常見，約占70%，爲肛管周圍膿腫的後果。瘘管隻穿過内括約肌，外口常隻有一個，距肛緣較近，約3～5cm。少數瘘管向上，在直腸環肌和縱肌之間形成盲端或穿入直腸形成高位括約肌間瘘。

　　2.經括約肌肛瘘　可以爲低位或高位肛瘘，約占25%，爲坐骨直腸窩膿腫的後果。瘘管穿過内括約肌、外括約肌淺部和深部之間，外口常有數個，并有支管互相溝通。外口距肛緣較近，約5cm左右，少數瘘管向上穿過肛提肌到直腸旁結締組織内，形成骨盆直腸瘘。

　　3.括約肌上肛瘘　爲高位肛瘘，少見，占5%。瘘管向上穿過肛提肌，然後向下至坐骨直腸窩穿透皮膚。由于瘘管常累及肛管直腸環，故治療較困難，常需分期手術。

　　4.括約肌外肛瘘　最少見，占1%，爲骨盆直腸膿腫合并坐骨直腸窩膿腫的後果。瘘管穿過肛提肌直接與直腸相通。這種肛瘘常由于克隆病、腸癌或外傷所緻，治療要注意其原發病竈。以上分類在高低位方面較細緻，有利于手術方法的選擇。

　　如肛管左右側均有外口，應考慮爲“蹄鐵型”肛瘘。這是一種特殊型的貫通括約肌肛瘘，也是一種高位彎型肛瘘，瘘管圍繞肛管，由一側坐骨直腸窩通到對側，成爲半環型，如蹄鐵狀故名。在齒線附近有一内口，而外口數目可多個，分散在左右兩側，其中有許多支管，向周圍蔓延。蹄鐵型肛瘘又分爲前蹄鐵型和後蹄鐵型兩種。後者多見，因肛管後部組織比前部疏松，感染容易蔓延。

　　肛瘘的外口與内口的部位有何規律性？Goodsall(1900）曾提出：在中點劃一橫線，若肛瘘外口在此線前方，瘘管常呈直線走向肛管，且内口位于外口的相應位置；若外口在橫線後方，瘘管常呈彎型，且内口多在肛管後正中處，一般稱此爲Goodsall規律。多數肛瘘符合以上規律，但也有例外，如前方高位蹄鐵型肛瘘可能是彎型，後方低位肛周膿腫可能是直型。臨床上觀察到，肛瘘的直與彎，除與肛管的前、後有關系外，與肛瘘的高位及低位，與外口距肛緣的遠近，都有一定關系。Cirocco(1992)曾對一組肛瘘病例進行回顧性分析，以檢驗Goodsall規律預測肛瘘走行的準确性，認爲該規律對預測後方外口的肛瘘走行相當準确，特别是女病人，有97%内口位于後正中肛隐窩，但對前方外口的肛瘘預測不準，僅49%有放射狀瘘管符合該規律，因Goodsall未認識到前方肛瘘也有9%起源于前正中肛隐窩。

　　直腸指診：在内口處有輕度壓痛，少數可扪到硬結。探針檢查，隻在治療中應用，一般不能作爲診斷用，防止穿破瘘管壁，造成假内口。X線造影，自外口注入30%～40%碘油，照相可見瘘管分布，多用于高位肛瘘及蹄鐵形肛瘘。

　　影像學檢查：Yang(1993)對臨床疑有肛管直腸膿腫或瘘管17例，6例臨床上疑有膿腫，肛管超聲AUS檢查也有膿腫表現；另外82%（9/11）AUS查出有瘘管，而臨床常規檢查未能發現。Lunniss(1994)對比了AUS及磁共振成像檢查，認爲前者對括約肌間瘘有時有确診價值，而無法确診括約肌外瘘及經括約肌瘘，而後者對複雜性高位肛瘘，蹄鐵型肛瘘及臨床難以确診的疑難病例有絕對的優越性和準确率。